Kościół św. Jana Chrzciciela i św. Mikołaja w Ustce był pierwszą tego typu placówką, która została oddana gminie do odbywania nabożeństw. Świątynia została poświęcona w 1356 roku jako katolicka, a w 1539 roku została podłączona do kościoła protestanckiego. Okazało się, że liczba mieszkańców Ustki wzrasta do tego stopnia, iż należało wybudować ów kościół fiflialny.
Budynek został zbudowany szybko, z drewna dębowego i w XIX wieku osiągnął pojemność 200 osób  siedzących. Oprócz oczywistego zastosowania budynku jako świątyni był on też znakiem nawigacyjnym, dziennie ze swoją niepowtarzalną bryła i nocnym gdyż światła oknach kościoła było widać z bardzo daleka. Kościół rozebrano w 1889 roku, a jego pozostałościami jest skwer przy cmentarzu.